1221 Übereignung des von Kuno von Münzenberg in Sachsenhausen gegründeten Hospitals mit Kirche an den Deutschen Orden durch Kaiser Friedrich II.
1309 Einweihung der neuen gotischen Kirche. Sie ersetzt den alten romanischen Bau.
1517 Anbau der Sebastianskapelle (heute: Marienkapelle) durch Walther von Cronberg.
1631-1635 Die Kirche ist während der Besetzung Frankfurts durch die Schweden profaniert.
1709-1725 Erneuerung der Kommende. Vor die Westwand wird eine barocke Fassade gesetzt.
1748-1750 Barockisierung des Innenraums durch Kurfürst Clemens August von Bayern.
1809 Der Deutsche Orden wird in den Rheinbundstaaten aufgelöst. Fürstprimas Karl von Dalberg stellt den Gottesdienst ein und pensioniert die Geistlichen. Die Kirche ist von 1813-1818 profaniert.
1836 Das Haus Habsburg übergibt die ehemalige Kommende dem Deutschen Orden als österreichisches Hauslehen. Dort amtieren ein Pfarrverweser und ein Kaplan.
1881 Die katholische Gemeinde Frankfurt erwirbt vom Deutschen Orden die ehemalige Kommende und regotisiert die Kirche.
1931 Deutschorden wird selbstständige Pfarrei.
1943 Bombenangriff zerstört das Deutsche Haus und beschädigt die Kirche stark.
1961 Der Deutsche Orden erwirbt Kirche und Kommende zurück und stellt seit 1963 den Pfarrer.
2014 Auflösung der Pfarrgemeinde. Die Kirche wird wie zur Zeit ihrer Erbauung Kirchort in der Dompfarrei.